2013年4月1日，酒泉南站開工建設(shè)；9月，酒泉南站主體工程完工。2014年11月，酒泉南站進(jìn)入工程建設(shè)的掃尾階段。2015年12月26日，酒泉南站隨蘭新高速鐵路的開通而投入運(yùn)營(yíng)。酒泉南站主體為兩層，局部含有夾層。采用“線側(cè)下式”布局和“下進(jìn)下出”旅客流線模式。站房?jī)蓚?cè)為附屬用房，中間為候車大廳 。站房地上兩層，為進(jìn)站層、站臺(tái)層；地下一層。進(jìn)站層設(shè)有進(jìn)站廳、候車大廳、售票廳、出站廳、貴賓室等功能用房，與入口廣場(chǎng)平層。夾層在售票廳一側(cè)設(shè)置通信、信號(hào)、信息等四電用房。出站廳側(cè)設(shè)有辦公、伙食團(tuán)、學(xué)習(xí)會(huì)議等功能。水泵用房和消防水池放在地下層。