2002年10月，原中華人民共和國國家計(jì)劃委員會批復(fù)溫福鐵路項(xiàng)目立項(xiàng)，規(guī)劃在福州市設(shè)站。 2004年8月，原中華人民共和國鐵道部、福建省人民政府、浙江省人民政府下發(fā)《關(guān)于新建鐵路溫福線初步設(shè)計(jì)的批復(fù)》，規(guī)劃設(shè)計(jì)在福州市連江縣設(shè)站。2005年8月26日，溫福鐵路全線開工，在福州市連江縣規(guī)劃建設(shè)連江站。 2009年6月30日，溫福鐵路全線開通貨運(yùn)列車，連江站投入貨運(yùn)運(yùn)營；同年9月28日，溫福鐵路正式開通動車組客運(yùn)業(yè)務(wù)，連江站正式投入客運(yùn)運(yùn)營。2019年12月30日起，連江站開始推行電子客票，旅客無需取票，刷證即可乘車。