2014年12月16日，隨著滬昆高速鐵路長沙至新晃段開通運營，芷江站投入使用。2019年12月10日起，芷江站實施電子客票，旅客直接刷二代身份證等有效證件即可進站乘車。芷江站站房設于線位南側，站坪坡度為平坡。芷江站站房中間為進站大廳，右邊為售票廳，左邊為出站口 。芷江站在站同左位置設列車保養(yǎng)點。芷江站西停車場作為城市公共客運車輛專用停車場，用來停放公交車和出租汽車。芷江站站場規(guī)模為2臺4線，設到發(fā)線2條，正線2條，側式站臺2座。芷江站兩端咽喉區(qū)各設1組渡線組成“八字”渡線。芷江站保養(yǎng)點內設大型養(yǎng)路機械停留線、確認車停留線各1條。途經芷江站的線路為滬昆高速鐵路。